При использовании ЭКФ в клинической практике снижаются риски врачебных ошибок на этапах назначения фармакотерапии, уменьшается количество осложнений и побочных эффектов от применения лекарств, сокращается время приёма врача, повышается качество оказания медицинской помощи и снижаются затраты медицинской организации на закупку медикаментов за счёт более рациональных назначений врача.